Леонид Сысолетин

var value_1 = document.getElementById('first').value;
var value_2 = document.getElementById('second').value;

Как посчитать расстояние между двумя точками на карте

Хоть так, хоть в куках.
Вы же понимаете, что эти хранилища - на стороне клиента, то есть никакого "соответствия" хранить не надо, надо только хранить одну-единственную переменную "я уже подписался"?

В tokens ты кладёшь объект. а вовсе не копию объекта на момент покладания в tokens. Фактически, ссылку на объект. Так что логично, что при изменении объекта в одном месте изо всех остальных мест он выглядит изменившимся.
В tokens надо класть не объект, а его копию. Например, так.

Вот тут уже решили, что это нифига не просто.

var one = [{id: '1'}, {id: '2'}],
	two = [{id: '2'}, {id: '5'}],
	twoIds = [];

for ( i in two ) {
	if ( two.hasOwnProperty(i) ) {
		twoIds[two[i].id] = 1;
	}
}

for (i in one) {
	if ( one.hasOwnProperty(i) ) {
		if ( twoIds[one[i].id] !== undefined ) {
			one[i].field = true;
		}
	}
}

Так передавать функцию нельзя.
Должно помочь

setInterval( function(){ window.location.reload() }, 100 );

cluster.getGeoObjects() отдаст массив со всеми объектами в данном кластере.