suhuxa1

Если у вас есть проблема и вы решили использовать регулярные выражения, у вас уже две проблемы.

Серьезно, разбирать html при помощи регулярных выражений - довольно плохая идея. Только если вы хорошо понимаете что вы делаете, как оно работает и в каких условиях.

Есть же php.net/manual/en/refs.xml.php
php.net/manual/en/book.dom.php
И более удобные, но менее шустрые штуки типа Zend_Dom_Query
(к более старой версии есть инструкция на русском)

происходила сверка информации - данные обновлялись, а те, которых нет - добавлялись?

insert ... on duplicate key update

добавляются\убираются какие-то позиции

каким образом удаляются? передается ид и модификатор удалить?

Создать индексы составные, делать count запросы, что бы не дергать те данные, которые не изменились. Более подробный ответ можно дать если Вы хотя бы пример данных дадите. Что и как в базе? Что приходит и в каком виде по api? Откуда цифра 40 секунд взялась и насколько принципиально обновлять именно с такой периодичностью?