Я бы на вашем месте сформулировал бы вопрос конкретнее: что мне использовать для, скажем, складского учета в интернет-магазине с 10-ю сотрудниками.
Ответ на исходный вопрос: разница в функционале. Однозначной классификации нет. Универсального недорого решения нет. Недорогие узкоспециализированные системы обычно существенно лучше по функционалу, чем относительно недорогие универсальные. При этом чем универсальнее система, тем она дороже.
