Нужно знать параметры доступа: хост, пользователь и пароль (или другую опцию).
Потом, можно подключиться через консоль и все делать с помощью команд, а можно через GUI.
Консоль: проще всего скачать git-scm и через его консоль легко подключиться.
GUI: я выбираю WinSCP. Все очень просто и понятно и удобно.