Оформите договор подряда и укажите, что результатом деятельности является такая-то программа с передачей прав собственности.
Только это гарантий все равно не дает. Самые лучшие гарантии это изолированное помещение без выхода в интернет где работник должен выполнить перед вами обязательства. Это не шутки! Такое практикуется на самом деле.