В трудовом договоре обязательно должно быть указано - как и на что работодатель получает исключительные права. В стандартном случае - на авторские произведения (программы), созданные работником в рабочее время, с использованием оборудования (ПК и IDE) работодателя. Обычно, если работник создаёт отдельный продукт, то от работодателя может быть задание на разработку, с описанием ПО.
В любом случае, бремя доказывания в суде, что работник что-то украл - лежит на обвиняющий стороне.
