O_o что такое /etc/messages?
/var/log/kern.log включает в себя вывод dmesg, сообщения об ошибках монтирования, а также различные неприятности с железом и ядром можно посмотреть там. Если у вас все падает в процессе загрузки или работы, то в этом файле, скорее всего вы найдете причину. Хотя, не факт, смотря как падает.
Это kernel log, заведует в debian этой штукой rsyslogd, модуль imklog. Можно настроить, как душе угодно, если поставить, например syslog-ng.