1. Вложенный цикл у Вас некорректен.
Вместо for(int j=0;j <A.length; j++) нужно прописать for(int j=0 ;j<A[i].length; j++).
A.length для двумерного массива - это количество строк, а A[i].length - количество элементов в каждой i-й строке этого массива. То есть Вы сначала получаете строку в виде массива, потом перебираете каждый элемент полученного массива-строки.
2. Размерность массива A - исходя из п. 1. n = A.length, m = A[0].length. То есть можно так (при условии, что массив не пустой): int[][] posA=new int[A.length][A[0].length], и тогда параметры n и m не нужны.