команда
screen запустит автономную сессию, от которой можно отключиться и потом подключиться снова.
В сессии
screen, уже не боясь оставить/отключиться, вместо
scp, может, удобнее воспользоваться
rsync — он зипует, что может ускорить передачу:
rsync -avz /var/www/projectOldName user@newserver.example.com://var/www/projectNewName
И нажать
Ctrl + A,
D — чтобы покинуть работающий вирт. терминал и спокойно отключиться от SSH. Позже, когда снова зайдете, командой
screen -r снова подключитесь к оставленной сессии.
