sergeyfast

Для проектирования БД мы используем Toad Data Modeller версии 2.25. Версию 3.+ они испортили, к сожалению (хотя другие считают иначе:). В версии 2.25 — нормальный интерфейс, рисует хорошие схемки.
Для работы с БД — SQL EMS Manager, лучше, пожалуй, не видел.

Код — svn, git, как многие уже рекомендуют.
Если для программистов — то Redmine, пожалуй, отлично подойдет.
Ещё есть www.teamer.ru — очень простая система управления проектами, habrahabr.ru/search/?q=teamer.

Ну и есть ещё одна разработка bulyonov.ru/2010/08/02/внимание-розыск-бетатестеров/
Если понравится — пишите ЛС)