На том уровне абстракции, где работает GAE, никаких контейнеров нет. Google предоставляет платформу, на которой можно запускать приложения и не заботится о том, как она работает под капотом. В этом и плюсы, можно думать только о коде и не отвлекаться на инфраструктуру.