Если не снимая образ а только файлы отдельно то я использую urbackup но я не уверен как он будет работать с 3тб и сколько же места надо чтобы иметь актуальную версию за 2 месяца. А если сервер находит на esx и схд то имхо самая удобная Veeam Backup & Replication