$document->setImageValue('image', array('path' => $uploadFile, 'width' => 120, 'height' => 60, 'ratio' => false));
Меняю на $document->deleteBlock('image', array('path' => $uploadFile, 'width' => 120, 'height' => 60, 'ratio' => false));
$document->setImageValue('podpis', array('path' => $uploadFile, 'width' => 120, 'height' => 60, 'ratio' => false));
$document->setImageValue('image', array('path' => $uploadFile1, 'width' => 140, 'height' => 140, 'ratio' => false));
$document->saveAs($outputFile);
// Имя скачиваемого файла
$downloadFile = $outputFile;
// Контент-тип означающий скачивание
header("Content-Type: application/octet-stream");
// Размер в байтах
header("Accept-Ranges: bytes");
// Размер файла
header("Content-Length: ".filesize($downloadFile));
// Расположение скачиваемого файла
header("Content-Disposition: attachment; filename=".$downloadFile);
// Прочитать файл
readfile($downloadFile);
unlink($uploadFile);
unlink($uploadFile1);
unlink($outputFile);