rumkin

Посмотрите в сторону DOMDocument. Он позволит использовать максимально близкие интерфейсы по работе с dom на сервере и на клиенте.
На клиенте, выделяем текст, находим ближайшего потомка, высчитываем для него xpath и офсет, передаем на сервер xpath, офсет и комментарий.

Надеюсь помог.

Посмотрите в сторону Silex — это вообще микрофреймворк, все что нужно можно подключить из Symphony, откуда он (Silex) родом. Либо вообще посмотрите в сторону микрофреймворков, fat-free, например.