Разобрался. В моём случае подходит в package написать скрипт примерно с таким содержанием
node -e require(./task/blabla.js)()
или
node -e require(./task/blabla.js).funk1()
если нужна какая-то конкретая функция.

Потом на раб столе создаёшь батник который делает примерно следующее
cd C:/blabla
npm start-script blabla

простое и эффективное решение