Я сделал так, добавил файл .prettier и несколько настроек в него. Но не помогло, остался конфликт в мелких настройках.
Отключил formatOnSave для prettier, оставил для eslint.
"editor.codeActionsOnSave": {
"source.fixAll": false,
"source.fixAll.eslint": true,
"source.fixAll.prettier": false
},
Flow такой:
Руками запуcкаю prettier ALT+F (поправляю форматирование).
Потом сохраняю и eslint фиксит все проблемы