Использую в своём последнем проекте jQuery 1.8.2 + jQuery UI 1.9.0. Никаких проблем описанных вами пока не встречал. Анимация работает как и в предыдущей версии.
Ответа не дождался. Вроде у самого получилось, но для это пришлось перекрыть пару методов виджета slider.
Вот тут мой пример, если кому интересно: jsfiddle.net/jeka5555/d5wUS/9/
