1. Я бы вам советовал определится где вносятся данные о товаре, и это должно быть одно место - источник этой информации. Поля синхронизации продумать, чтобы искало нормально и не плодило дублей. Это довольно массовая проблема. Я бы источником делал 1с.
2. Мне кажется вам нужно только продажу делать в связке 1с-сайт. Зачем вам при закупке что-то делать, кроме как выгружать на сайт новые позиции, которых раньше не было.
3. Остатки на сайте для показа пользователю некоторые рекомендуют не детализировать до единицы (нет, мало, много) - этого хватит.
всё имхо.
