Однозначно малинка будет быстрее, если вы конечно пакеты не по байтно будете вручную разбирать. Потому что сами данные будут передаваться нативными методами (порт uart будет файлом а значит в него будет просто сискол записи блока данных).
Если у вас будет преобразование данных - то все зависит от этого преобразования и того как вы его реализуете, но даже в этом случае малинка зачастую будет на порядок быстрее, ведь там как минимум частота в 10 раз быстрее, 4 ядра вместо одного и т.п.