rPman

Тебе нужен критерий, как отличать старые записи (дубликаты или не изменившиеся, тебе виднее что там) от новых.

Если удобного идентификатора нет, то обычно самое простое, - формировать из сравниваемых данных строку одинаковым способом, и получать из нее хеш сумму (md5 более чем подходит, если данных не 16-значное количество, т.е. не нужно заботиться о коллизиях), его и используй как идентификатор и храни где-то списком как предыдущие значения и сравнивай с ново загруженной, прямо во время анализа. Записи, хеш сумма которых, не была найдена в записях, помещай в базу данных (ну или обновляй значения, если речь идет о модификации а не добавлении новых).

mongodb поддерживает компрессию, поэтому храни в int (причем значения от 0 до 9 а не код символа) тогда нули в базе будут оптимизированы и сжаты

если в пределах одного документа нужно хранить много данных - используй BinData это bson сериализация, она вроде очень эффективна

ну и если просто нужно в документе хранить список чисел - то строки

p.s. моя чуйка чует что используется неподходящий инструмент под задачу

Очень внимательно читай лимиты free tier, может оказаться так что твои задачи выжрут его за сутки а потом у тебя будет указанная цена.

Чтобы не попасться как тут https://habr.com/ru/post/532624/ (ведь могут не простить!)

Бизнес у них такой, что нужно сначала запутать со сложными тарифами, снять с вас деньги, а потом разбираться.

p.s. привязка банковской карты это механизм авторизации, чтобы вы не взяли на себя 100500 бесплатных аккаунтов