Как сделать прокрутку страницы с разной скоростью, для чтения?

Gagatyn, добавьте

$(window).bind('mousewheel DOMMouseScroll',function(){
	$("html, body").stop();
});

Как поменять местами сайдбар и товары?

Это не решение а костыль.

Как, проскролив определенную высоту, поменять background у дива с классом header?

Попробуйте так :)

.header {
  transition:  300ms;
}

Как сделать прокрутку страницы с разной скоростью, для чтения?

Gagatyn, а кто мешает вешать обработчик скроллинга для остановки анимации?