Вангую, что в начале файла /usr/local/bin/docker-entrypoint.sh есть строка вроде "/bin/bash". После редактирования под виндой в конце этой строки образовалось стандартное виндовое отбитие CRLF, в то время, как линукс использует только LF. Решается настройкой line break в вашем редакторе.