Я бы в такой ситуации не раздумывая шел на прикладную математику.
Во-первых, она, как говорил великий, "ум в порядок приводит".
Во-вторых, мне известно множество случаев когда человек мог засесть за несколько толковых книжек и изучить программирование самостоятельно до уровня, который позволил устроиться на работу. А вот с математикой (на должном уровне) такой трюк не прокатит, как ни крути.
Ну и в-третьих, в крутом вузе вас обучат математике круче, чем в слабеньком - программированию (разумеется, если под "крутостью" подразумевается именно объем материально-технической базы и качество преподавательского состава), а учитывая что багаж знаний у вас уже имеется - готовьтесь к длительной "буксировке" при изучении программирования в вузе.
