Марк

Вероятно, на них есть (были) ссылки, внутренние или внешние.

derbyjs.com — у этой штуки в примерах кода есть несложный «совместный текстовый редактор», допилить до состояния WYSIWYG можно запросто.

Ссылка в гитхаб: https://github.com/derbyjs/derby-examples

Комментарии к участкам текста есть вот тут, например. Клик по левому полю напротив интересующего места в тексте открывает комментарии. Решение open source.