Сейчас 
рекомендуют  использовать 
Angular Cli. Лучше воспользоваться им. Он много сделает за вас, в плане настройки проекта. И если вы пользуетесь webstorm или 
vscode, то зависимости добавятся автоматически (почти).  Angular Cli использует 
webpack, а не SystemJS. Так же Angular Cli существует в виде плагинов под популярные IDE.