pentarh

В reiserfs было много оптимизаций по поводу большой кучи мелочи, посмотрите reiser4

fat не катит в плане ограничения на макс объем файла.
*никсовые ФС не катят, т.к. без дополнительного гемороя винда их не увидит.

А винда больше и ничего не знает. Так что NTFS.

Забудьте iscsi, ATA Over Ethernet — нативная поддержка в ядре, простота и скорость. Зачем вам дополнительная прослойка TCP/IP?

В качестве ФС — GFS, LUSTRE из бесплатных, GPFS платная, но оно того стоит. Юзаю GPFS + AOE. Доволен

MogileFS ливжурналом была изначально создана для этой цели.