На странице Administrator Guide » Repositories подробно описан процесс настройки репозиториев в Редмайне, а так же указаны требования для Git
Репозиторий предназначенный для Редмайна должен быть bare типа, но не working tree - возможно у тебя именно эта проблема
git clone --bare {{repo_url}} {{local_path}}
Затем полный путь до {{local_path}} указать в Редмайне