paran0id

Что значит "запустить"? vim использует по умолчанию файл ~/.vimrc
Если хотите использовать другой, запускаете vim с ключом -u и указываете путь к желаемому файлу. Это есть в хелпе.

Потому что это не две строки, а одна большая с переносом.

Они появляются, когда редактируешь файл, и должны исчезать, когда корректно выходишь из вима.