papersaltserver

Разверните VDI, будете из любого места работать с одним профилем.

Так как соединения каждый раз будет устанавливаться с разными IP адресами, то весь траффик пойдёт через шлюз по умолчанию, который устанавливается на уровне системы. Насколько мне известно задать специфический шлюз по умолчанию для конкретной программы невозможно.
Как вариант я бы создал виртуальную машину специально для торрентов и весь её траффик пустил четез йотовский интерфейс.

Spiceworks + community.spiceworks.com/plugin/324
Бесплатно и просто. Проще zabbix-а уж точно, но конечно не так гибко.

Не стоит забывать также, что наличие локального репозитария создаст дополнительную нагрузку на сервер, если под раздачу апдейтов не выделен отдельный сервер. А также дополительную задачу администрирования.