Во-первых, карманный справочник по командам, который тут уже посоветовали - очень занимательное чтение!
А во-вторых, просто решайте текущие задачи. Все делайте через консоль - обновляйте систему, просматривайте каталоги, редактируйте конф файлы в виме. Запоминается то, что вы регулярно используете - эта фраза тут уже на тысячу ладов повторена, но это правда так.