Не совсем понятна постановка задачи. Как я понял, тебе нужно:
1)Добавить див в iframe при драг'н'дропе
2)В стилях дива должно быть прописано position:absolute (относительно родителя, т.е фрейма)
3)Назначить диву позицию (top и left)
Что-то типа этого:
//создаем iframe, в принцепи не важно как ты его создаешь, главное присвоить ему имя
var iframe = document.createElement("iframe");
//создаем див и назначаем стили
var div = iframe.document.createElement("div");
div.style.position = "absolute";
div.style.top = x+"px";
div.style.left = y+"px";
iframe.document.body.appendChild(div);
