Что вы пытаетесь устанавливать, какие команды приводят к этому? Подозреваю, что проблемы на самом деле нет. И, да, centos, как и debian прекрасно работает с разными архитектурами одновременно, главное, чтобы то, что вы устанавливаете умело так работать.