Файлы с основными стилями поместите в папочку, например, "base";
Файлы с остальными стилями (модули, компоненты) поместите в другую папочку, например, "other";
И на одном уровне с этими папочками создайте файл, например style.scss, куда импортируйте главный style.scss с папки base и главный style.scss с папки other.