В процессе поиска ответов нашёл решение проблемы на tex.stackexchange.com.
Пакет
secdot позволяет добавить точки в нумерацию секций на страницах самой статьи.
А вот с помощью пакета
tocloft и строки
\renewcommand{\cftsecaftersnum}{.} появляются точки и после цифр в содержании.
Оригинал решения проблемы:
https://tex.stackexchange.com/questions/187699/toc...
Однако хочу ещё обратить внимание на то, что если в статье так же используется пакет
subfigure, то он будет конфликтовать с
tocloft. Это решается добавлением [subfigure] в
\usepackage[subfigure]{tocloft} 