Ilia Malashko

Найти место, где генерятся эти запросы не сложно - достаточно запустить Монитор производительности с записью sql-запросов.

Так найдется место где неоптимизированный запрос. На вкладке с запросами можно будет запустить анализ индексов.

Сайт на 1с-Битрикс.

Вот и проблема.
Дальше читать не имеет смысла.

Текст запроса значения тоже не имеет - нужны данные о самих таблицах: размер, индексы, типы полей, по которым идут джойны.
Это целая аналитическая работа.
Смотри план выполнения

Сверху справа расширение которое вырубает рекламу и черпает ваш js код :)