Вопрос нужно решить на php?
UPD: Попробуйте как-то так:
$basepath = '/path/to/folder';
$filelist = scandir($basepath);
foreach($filelist as $i => $filename) {
if($filename !== '.' && $filename !== '..') {
rename ($basepath.'/'.$filename, $basepath.'/'.$i.'.jpg');
}
}