Для вас никаких проблем не будет, если вы будете работать только с одним заказчиком и платить 13% подоходного налога как законопослушный гражданин. Сам я именно так сейчас и работаю, и знаю людей, которые работают так несколько лет.
Если вы будете работать с несколькими заказчиками одновременно (например, получать платежи на один и тот же счет), то без регистрации как ИП вас гарантировано сначала прижмет банк, так как тарифы для ИП у них отдельные, а потом налоговая инспекция в плане «незаконного предпринимательства» (а может и обойтись).
Если бы вы так работали на российского заказчика (или иностранная компания имеет представительство в России), то может быть риск в том плане, что отношения могут быть признаны через суд трудовыми (по запросу какого-нибудь органа), а раз так, то и наступила бы ответственно за неуплату части налога. Скорее всего для заказчика.