У меня был опыт работы и там и там, правда у меня перед ними был обширный опыт работы.
Основная проблема стартапа - даже если вы сделаете продукт, не факт, что у вашего менеджера хватит опыта и мозгов его продать. Как итог, с высокой степенью вероятности все ваши геройства окажутся невостребованными в нужной степени. Второй момент - если вы надеетесь, что будучи у начала стартапа вы будете иметь процент от ее прибыли, то это зачастую не так. Обычно вы будете все также работать за зарплату. Если вам обещают акции - акции можно потом размыть, не выплачивать по ним дивиденты, или сделать для верхов отдельный привилегированный класс акций.
Проблема больших компаний - бюрократия. Если вам станет душно в них работать, можно сменить компанию например. Раз в три года, это как то даже освежает. И не во всех больших компаниях высокий уровень бюрократии.