$mysqli->query('INSERT INTO `QueryTypes` SET `query_type` = "нужные данные" ON DUPLICATE KEY UPDATE `id` = LAST_INSERT_ID(`id`)');
//echo $mysqli->insert_id; тут будет ID новой записи или той которая была обновлена по уникальному ключу
$logs = new Logs();
$logs->query_type = $mysqli->insert_id;
$logs->save();