matperez

самый правильный вариант вот https://github.com/samdark/yii2-cookbook/blob/mast... еще и автокомплит заработает.

тут вот есть перевод
krivochenko.ru/blog/post/autocomplete-code-for-cus...

Обратите внимание на поддержку Vagrant https://confluence.jetbrains.com/display/PhpStorm/...
www.youtube.com/watch?v=f7Kss62DHhw

Папка проекта становится общей между вашим локальным хостом и виртуальной машиной. Само редактирование происходит локально, виртуальная машина используется только как среда выполнения для вашего кода.

Сначала settings -> tools -> external tools - добавляете свое приложение для запуска
Потом settings -> appearance & behavior -> menus and toolbars -> main toolbar - добавляете свою кнопку на панель.
Изменять иконку не получится. Можете сделать две кнопки, для запуска и остановки. В самих вызываемых скриптах уже разруливайте работает ли сейчас что-то и нужно ли это остановить или запустить.