Понимаю, что вопрос уже устарел, но вдруг кому поможет.
У меня была такая же проблема на Windows 7, где стоял HDD. Буквально на днях я перешел на Mac OS, где стоит и SDD и эта проблема сама по себе исчезла. Так что действительно у кого такая трабла, то либо ставьте задержку на gulp watcher или покупайте SSD.