Если вм на esxi то:
1. занулить блоки в linux (dd bs=1M count=15000 if=/dev/zero of=zero) где count доступное свободное место (узнаем в df).
2.1 Если датасторов несколько мигрируем между датасторами.
2.2 Если датастор один на esxi выполняем команду vmkfstools -K --punchzero /path/to/vmdk/disk.vmdk