Вряд ли кто оценит мой ответ, но тем не менее.
Евгений, меня несколько лет назад то же мучил такой вопрос. Я тоже делал малые вещи сугубо по мануалам.
Вы изучаете инструмент? Вы изучаете перфоратор или пылесос? Нет, вы идете от задачи. Если нужно пропылесосить, вы берете пылесос. Нужно сделать отверстие в бетонной стене? Вы берете перфоратор и особым образом его используете.
Изучение любого софта должно быть по такому же принципу. Начните с задачи. Зачем вам Линукс, что вы от него хотите?
Мое изучение началось с требование- изучить Астериск. А Астериск неотрывен от Линукса. Ну и понеслось.
Начните с задачи и далее все пойдет быстро и сами не заметите, как станете профи.