Примерно год назад, довольно долго промучившись с интеграцией matplotlib в PyQt-приложение, открыл для себя замечательную библиотеку
PyQtGraph. Из плюсов могу отметить более удобную интеграцию в приложение и, что для меня было важно, скорость работы при отображении динамических данных.