Не смотря на давность вопроса, все равно остается актуален и по сей день. А ответ очень прост: в Safari во вкладке вид ищем пункт "показывать строку состояния" или ⌘/
Вдруг у кого до сих пор не работает, то нужно по окну консоли нажать "Свойства" и внизу поставить флаг на "Использовать устаревшую консоль". После этого перезапускаем консоль в Webstorm\Phpstorm.
