Вдруг у кого до сих пор не работает, то нужно по окну консоли нажать "Свойства" и внизу поставить флаг на "Использовать устаревшую консоль". После этого перезапускаем консоль в Webstorm\Phpstorm.

Виртуализация не OpenVZ, случайно? Если да, то ядро обновить невозможно.