> Как правильно получить частотный спектр этих данных?
Спектр всегда частотный, а масло - масляное
> Ожидаю, что должен вылезти пик на амплитуде "2".
Вот это вообще непонятно что означает
Смотри: у тебя есть какие-то дискретные события, происходящие в произвольные моменты времени, например, ты сидишь под яблоней и, когда падает яблоко - засекаешь время. И ты хочешь что-то понять про периодичность, связанную с этими событиями.
Первое - временные рамки. Помимо времени падения первого и последнего яблока понадобятся моменты начала и конца наблюдений. Пусть это будут 00:00 и 24:00.
Второе. Дискретное преобразование фурье работает с периодическими отсчетами, например, сколько яблок упало за каждый час в течение суток (те 24 отсчета). БПФ - алгоритм, требующий, чтобы число отсчетов было степенью двойки (в моём примере возьму 32 отсчета по 45 мин).
Третье. Если яблок падает мало, а вытянуть из опыта хочется по-максимуму, можно попробовать интерполяцию, например, если в 12:30 упало 1 яблоко, это можно интерпретировать так: в 12:00 упала 1/3 яблока и в 12:45 - остальные 2/3. Для корректной интерполяции на краях временного диапазона неплохо бы прихватить по 45мин наблюдений до и после.