Проблема была в редиректе в шаблоне на https
Если оно стоит, то сертификат не перевыпускается
Конкретно была такая строка return 301
https://$host$request_uri;
Сертификат перевыпущен, но теперь 500 ошибка почему-то.
Перезапустил nginx и php-fpm, все поднялось!