Ivan Ivanovich, Вроде бы я видел эту инструкцию к подключению node, и ковыряний там не было. В таком случае что-то с панелью. Лучше обратиться к техподержке весты.
Инструкция то старая, там ошибки в весте при установке новой центос возникают, а тут убунту. Скорей всего дело именно в ней. Если впс, попробуйте более старые версии убунту поставить.
