Мэтт Зандстра: PHP. Объекты, шаблоны и методики программирования. Хоть и немного отстаёт от актуальных версий PHP, но зато очень доступно и полно

Pencil

Попробуйте обрабатывать нажатие на кнопку по событию onmousedown, а не по клику. onmousedown наступает раньше и вы успеете нормально обработать событие, до потери фокуса. А чтоб выделение вообще не сбросилось напишите в конце обработчика return false;

var file = document.getElementById('file').files[0];
var reader = new FileReader();
var blob = file.slice(slice_start, slice_end);
reader.readAsBinaryString(blob);

reader.onload = function(b) {
...
}